Programas de Computador Saúde

CaRinDB: Um banco de dados integrado de mutações comuns em câncer e parâmetros de rede de interação de resíduos

Descrição

CaRinDB (https://bioinfo.imd.ufrn.br/CaRinDB/ ) é um portal de dados interativo que integra dados de mutações em câncer do The Cancer Genome Atlas (TCGA) e suas previsões de efeito e características, incluindo parâmetros baseados em grafos de Redes de Interação de Resíduos calculados a partir de estruturas do Protein Data Bank (PDB) e modelos preditos por computador do AlphaFoldDB. No CaRinDB, essas diferentes informações podem ser recuperadas e visualizadas interativamente, fornecendo recursos adicionais para avaliar as consequências estruturais das mutações. Além disso, ele disponibiliza uma coleção estruturada de dados com parâmetros de conectividade de resíduos, frequência alélica, integração com bancos de dados biológicos e previsões funcionais de vinte ferramentas distintas.

Inventores

• DANIELA COELHO BATISTA GUEDES PEREIRA
• PATRICK CESAR ALVES TERREMATTE
• JOÃO PAULO MATOS SANTOS LIMA
• THAÍS GAUDENCIO DO RÊGO
• JORGE ESTEFANO SANTANA DE SOUZA
• RAUL MAIA FALCÃO
• RODRIGO JULIANI SIQUEIRA DALMOLIN
• JOÃO VITOR FERREIRA CAVALCANTE

Cotitularidade

Universidade Federal da Paraíba - UFPB

Status

Registro Concedido

Nº do Pedido: BR 51 2025 001160-1

País

Brasil